对於新手而言，硝化菌是未曾听过的名字，但是对於玩家而言，这三个字足以决定是否可以养好一缸鱼的关键，不论淡水缸、海水缸甚至繁殖缸，硝化菌是否存在於鱼缸之中，是非常重要的。
　　 很多初次养鱼的人一开始遇到的问题不外乎：明明昨天刚买回来还好好的，喂了饲料之後，怎么隔日仅剩下几只鱼，再过一、两天则全军覆没？於是对於养鱼就认为自己没有天份，怎么养都养不活。其实，是缸中缺少了硝化菌，没有建立好硝化系统就贸然放鱼的缘故。要建立好硝化系统并不困难，但是对於新手而言，开始养鱼只要选购喜欢的鱼、一个简单的缸子、一个空气帮浦外加一条风管提供氧气就够了，喂食时尽量让鱼儿们吃饱，这就是所谓＂养鱼＂了。当然，用这种完全想像式的方法，只能满足一下子养鱼的乐趣，接下来可想而知的就是死鱼的痛苦了。 　　好氧与厌氧
　　硝化菌之所以重要，在於它能将水中的有毒物质：氨，给分解掉。氨是由鱼只的排泄物，或者过多的喂食所产生的残饵所产生，氨的存在会对鱼、水草、珊瑚，甚至可以说鱼缸中的所有生物，构成相当的危害，只要超出安全浓度 ( 约零点五 ppm) 即可能造成生物的死亡。硝化菌可以藉由硝化作用将氨转变为仍然具有毒性的亚硝酸盐，再将亚硝酸盐转变为毒性相当低的硝酸盐，让生物远离生命的威胁，而此一作用称为硝化作用，由於硝化菌在此阶段会消耗缸中的氧气，所以有玩家称硝化菌为好氧菌，如果硝化菌能够在您的鱼缸中顺利成长，则相信鱼儿就不会中毒死亡。
　　 经过硝化作用後的产物即是硝酸盐，虽然毒性没那么强，水草的生长还需要硝酸盐当作肥料，但是只要在浓度五十 ppm 以上，水中过多的营养就很有可能造成藻类横生的现象，并可能造成生物生长的迟缓。所以，我们除了在鱼缸中培养硝化菌之外，也要培养厌氧菌，让其进行所谓的＂脱氮作用＂， 将硝酸盐转为氮，逸失在空气中，藉此将缸中的硝酸盐控制在一定的数值以下。
　　如何培养
　　既然硝化菌那么重要，那该如何培养呢？其实，最简单的方法就是使用他人用过的过滤棉，将其在自己的缸中搓洗，藉著搓洗的动作好让硝化菌顺利附著在新的缸中，或者也可以向他人购买已经使用一阵子的陶瓷环、生化球，摆在自己的过滤槽中。但是如果没有朋友有养鱼，建议可以购买市售的硝化菌液，不过市售的硝化菌液品质参差不齐，有部分信誉良好的公司会贩售真的处於休眠状态的硝化菌，而部分公司则是贩售硝化菌的＂营养液＂，让您缸中的硝化菌得以快速的生长，不过这种＂营养液＂对於新设立的缸是没有多大用处的，购买时请千万注意，建议可以购买知名厂牌的硝化菌，可能较有保障。

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